Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGEF1Q9UJ41 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
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