Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms