Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT2

UBA2, SUMO-activating enzyme subunit 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA2Q9UBT2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA2Q9UBT2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA2Q9UBT2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA2Q9UBT2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA2Q9UBT2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA2Q9UBT2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA2Q9UBT2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA2Q9UBT2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA2Q9UBT2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA2Q9UBT2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA2Q9UBT2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA2Q9UBT2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA2Q9UBT2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA2Q9UBT2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA2Q9UBT2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA2Q9UBT2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA2Q9UBT2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms