Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSDMCQ9BYG8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms