Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF1Q9BQI6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms