Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E2Q96LR5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms