Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS50Q96JG6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS50Q96JG6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms