Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC13Q8IYE1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC13Q8IYE1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC13Q8IYE1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms