Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
LRRC9Q6ZRR7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LRRC9Q6ZRR7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC9Q6ZRR7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms