Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC62Q6P9F0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC62Q6P9F0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC62Q6P9F0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms