Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC30Q5VVM6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC30Q5VVM6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC30Q5VVM6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms