Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXT1Q16394 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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EXT1Q16394 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXT1Q16394 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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