Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH18Q13634 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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