Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC63Q05C16 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC63Q05C16 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms