Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POU5F1Q01860 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POU5F1Q01860 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU5F1Q01860 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms