Protein–RNA interactions for Protein: P55347

PKNOX1, Homeobox protein PKNOX1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1P55347 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PKNOX1P55347 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKNOX1P55347 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms