Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS1P54277 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS1P54277 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS1P54277 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS1P54277 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS1P54277 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS1P54277 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS1P54277 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS1P54277 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS1P54277 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS1P54277 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS1P54277 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS1P54277 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS1P54277 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS1P54277 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS1P54277 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS1P54277 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS1P54277 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS1P54277 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS1P54277 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS1P54277 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS1P54277 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS1P54277 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMS1P54277 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMS1P54277 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMS1P54277 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMS1P54277 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS1P54277 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS1P54277 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS1P54277 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS1P54277 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS1P54277 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS1P54277 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS1P54277 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS1P54277 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms