Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB1P53618 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB1P53618 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB1P53618 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB1P53618 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB1P53618 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB1P53618 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB1P53618 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPB1P53618 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPB1P53618 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB1P53618 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB1P53618 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB1P53618 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB1P53618 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB1P53618 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB1P53618 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB1P53618 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB1P53618 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB1P53618 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB1P53618 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB1P53618 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB1P53618 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB1P53618 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB1P53618 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB1P53618 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB1P53618 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB1P53618 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB1P53618 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB1P53618 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB1P53618 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB1P53618 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPB1P53618 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB1P53618 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB1P53618 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB1P53618 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB1P53618 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPB1P53618 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPB1P53618 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COPB1P53618 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms