Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCG1P45844 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms