Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2BP42772 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms