Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYL1P12980 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYL1P12980 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYL1P12980 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYL1P12980 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYL1P12980 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYL1P12980 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYL1P12980 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYL1P12980 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYL1P12980 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYL1P12980 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LYL1P12980 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYL1P12980 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LYL1P12980 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYL1P12980 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LYL1P12980 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYL1P12980 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYL1P12980 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYL1P12980 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYL1P12980 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYL1P12980 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYL1P12980 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYL1P12980 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms