Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DMDP11532 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMDP11532 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMDP11532 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DMDP11532 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMDP11532 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMDP11532 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMDP11532 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMDP11532 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMDP11532 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DMDP11532 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DMDP11532 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DMDP11532 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DMDP11532 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DMDP11532 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DMDP11532 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DMDP11532 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DMDP11532 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DMDP11532 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DMDP11532 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DMDP11532 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DMDP11532 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DMDP11532 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DMDP11532 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DMDP11532 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DMDP11532 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DMDP11532 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DMDP11532 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DMDP11532 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DMDP11532 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DMDP11532 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DMDP11532 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DMDP11532 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DMDP11532 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DMDP11532 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DMDP11532 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DMDP11532 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DMDP11532 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DMDP11532 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DMDP11532 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DMDP11532 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DMDP11532 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DMDP11532 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
DMDP11532 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
DMDP11532 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DMDP11532 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DMDP11532 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DMDP11532 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DMDP11532 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DMDP11532 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DMDP11532 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DMDP11532 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DMDP11532 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DMDP11532 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DMDP11532 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DMDP11532 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DMDP11532 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DMDP11532 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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