Protein–RNA interactions for Protein: P11309

PIM1, Serine/threonine-protein kinase pim-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM1P11309 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIM1P11309 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIM1P11309 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIM1P11309 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIM1P11309 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIM1P11309 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIM1P11309 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIM1P11309 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIM1P11309 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIM1P11309 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIM1P11309 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIM1P11309 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIM1P11309 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIM1P11309 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIM1P11309 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIM1P11309 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIM1P11309 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIM1P11309 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIM1P11309 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIM1P11309 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIM1P11309 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIM1P11309 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIM1P11309 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIM1P11309 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIM1P11309 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIM1P11309 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIM1P11309 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIM1P11309 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIM1P11309 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIM1P11309 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIM1P11309 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIM1P11309 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIM1P11309 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIM1P11309 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIM1P11309 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIM1P11309 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIM1P11309 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIM1P11309 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIM1P11309 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIM1P11309 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIM1P11309 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIM1P11309 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIM1P11309 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIM1P11309 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIM1P11309 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIM1P11309 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIM1P11309 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIM1P11309 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIM1P11309 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIM1P11309 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIM1P11309 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIM1P11309 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms