Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP19O94966 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USP19O94966 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP19O94966 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP19O94966 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP19O94966 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP19O94966 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP19O94966 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP19O94966 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
USP19O94966 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP19O94966 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP19O94966 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP19O94966 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
USP19O94966 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
USP19O94966 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
USP19O94966 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP19O94966 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP19O94966 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP19O94966 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP19O94966 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP19O94966 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP19O94966 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP19O94966 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP19O94966 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP19O94966 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP19O94966 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP19O94966 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP19O94966 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP19O94966 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
USP19O94966 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP19O94966 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP19O94966 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP19O94966 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP19O94966 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP19O94966 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP19O94966 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP19O94966 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP19O94966 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP19O94966 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP19O94966 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP19O94966 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP19O94966 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP19O94966 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP19O94966 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP19O94966 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP19O94966 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP19O94966 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP19O94966 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP19O94966 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP19O94966 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP19O94966 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP19O94966 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP19O94966 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP19O94966 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP19O94966 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP19O94966 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP19O94966 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP19O94966 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP19O94966 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP19O94966 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
USP19O94966 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP19O94966 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP19O94966 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP19O94966 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP19O94966 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP19O94966 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP19O94966 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP19O94966 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
USP19O94966 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP19O94966 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP19O94966 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP19O94966 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP19O94966 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP19O94966 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP19O94966 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP19O94966 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP19O94966 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP19O94966 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP19O94966 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP19O94966 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP19O94966 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP19O94966 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP19O94966 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP19O94966 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP19O94966 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP19O94966 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP19O94966 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP19O94966 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP19O94966 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP19O94966 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP19O94966 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP19O94966 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP19O94966 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP19O94966 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP19O94966 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP19O94966 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP19O94966 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP19O94966 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP19O94966 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP19O94966 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms