Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSO75390 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSO75390 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CSO75390 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSO75390 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSO75390 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSO75390 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSO75390 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSO75390 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSO75390 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSO75390 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CSO75390 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSO75390 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSO75390 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSO75390 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CSO75390 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CSO75390 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSO75390 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSO75390 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSO75390 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms