Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4BP3O15049 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
N4BP3O15049 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms