Protein–RNA interactions for Protein: H0Y3Z8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0Y3Z8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
H0Y3Z8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H0Y3Z8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms