Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
RIMBP3BA6NNM3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RIMBP3BA6NNM3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
RIMBP3BA6NNM3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RIMBP3BA6NNM3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms