Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT87PA6NCN2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms