Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEU3Q9UQ49 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEU3Q9UQ49 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.7 ms