Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEFF2Q9UIK5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEFF2Q9UIK5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEFF2Q9UIK5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms