Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN11AQ9UI33 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms