Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CGGBP1Q9UFW8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CGGBP1Q9UFW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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