Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASS4Q9NQ75 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms