Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO1B3Q9NPD5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLCO1B3Q9NPD5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms