Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLK3Q9C098 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK3Q9C098 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK3Q9C098 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms