Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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SAMD8Q96LT4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SAMD8Q96LT4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SAMD8Q96LT4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMD8Q96LT4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SAMD8Q96LT4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SAMD8Q96LT4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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