Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCOLN3Q8TDD5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCOLN3Q8TDD5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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