Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PPARGC1BQ86YN6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPARGC1BQ86YN6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPARGC1BQ86YN6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPARGC1BQ86YN6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPARGC1BQ86YN6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PPARGC1BQ86YN6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PPARGC1BQ86YN6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PPARGC1BQ86YN6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PPARGC1BQ86YN6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PPARGC1BQ86YN6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPARGC1BQ86YN6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PPARGC1BQ86YN6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms