Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FXNQ16595 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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FXNQ16595 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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FXNQ16595 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FXNQ16595 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FXNQ16595 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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FXNQ16595 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FXNQ16595 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
FXNQ16595 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
FXNQ16595 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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FXNQ16595 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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FXNQ16595 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FXNQ16595 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FXNQ16595 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FXNQ16595 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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FXNQ16595 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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FXNQ16595 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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FXNQ16595 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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FXNQ16595 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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FXNQ16595 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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FXNQ16595 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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FXNQ16595 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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FXNQ16595 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FXNQ16595 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FXNQ16595 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FXNQ16595 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FXNQ16595 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FXNQ16595 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FXNQ16595 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FXNQ16595 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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