Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NID2Q14112 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NID2Q14112 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NID2Q14112 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NID2Q14112 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NID2Q14112 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NID2Q14112 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NID2Q14112 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NID2Q14112 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NID2Q14112 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NID2Q14112 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NID2Q14112 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NID2Q14112 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NID2Q14112 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NID2Q14112 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NID2Q14112 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NID2Q14112 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NID2Q14112 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NID2Q14112 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NID2Q14112 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NID2Q14112 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NID2Q14112 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NID2Q14112 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NID2Q14112 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NID2Q14112 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NID2Q14112 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NID2Q14112 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NID2Q14112 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NID2Q14112 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NID2Q14112 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NID2Q14112 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NID2Q14112 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NID2Q14112 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NID2Q14112 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NID2Q14112 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NID2Q14112 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NID2Q14112 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NID2Q14112 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NID2Q14112 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NID2Q14112 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NID2Q14112 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NID2Q14112 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NID2Q14112 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NID2Q14112 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NID2Q14112 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NID2Q14112 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NID2Q14112 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NID2Q14112 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NID2Q14112 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
NID2Q14112 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NID2Q14112 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NID2Q14112 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NID2Q14112 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NID2Q14112 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NID2Q14112 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NID2Q14112 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NID2Q14112 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NID2Q14112 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NID2Q14112 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NID2Q14112 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NID2Q14112 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NID2Q14112 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NID2Q14112 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NID2Q14112 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NID2Q14112 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NID2Q14112 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NID2Q14112 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NID2Q14112 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NID2Q14112 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NID2Q14112 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NID2Q14112 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NID2Q14112 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NID2Q14112 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NID2Q14112 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NID2Q14112 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NID2Q14112 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms