Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTAN1Q13813 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPTAN1Q13813 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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