Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIGQ13278 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIGQ13278 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIGQ13278 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIGQ13278 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIGQ13278 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RIGQ13278 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIGQ13278 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIGQ13278 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIGQ13278 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIGQ13278 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIGQ13278 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIGQ13278 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIGQ13278 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIGQ13278 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIGQ13278 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIGQ13278 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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