Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFIAQ12857 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFIAQ12857 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFIAQ12857 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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