Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 HMG1YML075C 3165 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 ALG9YNL219C 1668 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 SPO73YER046W 432 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 UTP11YKL099C 753 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 DSS4YPR017C 432 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 RSC58YLR033W 1509 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 APP1YNL094W 1764 nt3.79□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 FLC1YPL221W 2382 nt3.78□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 RIM21YNL294C 1602 nt3.78□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 VAC17YCL063W 1272 nt3.78□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 YGL188CYGL188C 174 nt3.78□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 YLR462WYLR462W 609 nt3.78□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 CUZ1YNL155W 825 nt3.78□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 CKS1YBR135W 453 nt3.78□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 RPG1YBR079C 2895 nt3.78□□□□□ -1.8
PRP46Q12417 BUD5YCR038C 1929 nt3.78□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 ALO1YML086C 1581 nt3.77□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 MET17YLR303W 1335 nt3.77□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 TRM11YOL124C 1302 nt3.77□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YDL228CYDL228C 642 nt3.77□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 PHO92YDR374C 921 nt3.77□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 PAM18YLR008C 507 nt3.77□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 PPA2YMR267W 933 nt3.77□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 VPS69YPR087W 321 nt3.77□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 ROK1YGL171W 1695 nt3.77□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 ISR1YPR106W 1332 nt3.76□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 FDC1YDR539W 1512 nt3.76□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 MSK1YNL073W 1731 nt3.76□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 DOS2YDR068W 933 nt3.76□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 COS12YGL263W 1143 nt3.76□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YJR038CYJR038C 363 nt3.76□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 PEX12YMR026C 1200 nt3.76□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 HEK2YBL032W 1146 nt3.76□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt3.76□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YPL071CYPL071C 471 nt3.76□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 URC2YDR520C 2319 nt3.76□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 IME4YGL192W 1803 nt3.75□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 BUD16YEL029C 939 nt3.75□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YER147C-AYER147C-A 411 nt3.75□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 RPL24AYGL031C 468 nt3.75□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YGL088WYGL088W 366 nt3.75□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt3.75□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt3.75□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 RAD27YKL113C 1149 nt3.75□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 LTO1YNL260C 597 nt3.75□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 MCP2YLR253W 1710 nt3.75□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 SPS2YDR522C 1509 nt3.75□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YCR023CYCR023C 1836 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 BUD8YLR353W 1812 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 SPC105YGL093W 2754 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 OSH2YDL019C 3852 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 PDR12YPL058C 4536 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 RPL8AYHL033C 771 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YLR428CYLR428C 345 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 DSE3YOR264W 1293 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 CBP3YPL215W 1008 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 FRM2YCL026C-A 582 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 HPR1YDR138W 2259 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 KRE29YER038C 1395 nt3.74□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 RTK1YDL025C 1863 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YCL075WYCL075W 441 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 HSP30YCR021C 999 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 NOP6YDL213C 678 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YDR133CYDR133C 336 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YMR085WYMR085W 1299 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YBL077WYBL077W 432 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 MDM12YOL009C 816 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 DSC2YOL073C 969 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 PBN1YCL052C 1251 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YSH1YLR277C 2340 nt3.73□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 SMP3YOR149C 1551 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 MTR10YOR160W 2919 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 PMC1YGL006W 3522 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 PHO84YML123C 1764 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YGL199CYGL199C 471 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 AIM22YJL046W 1230 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YKL071WYKL071W 771 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YAR030CYAR030C 342 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 MAP1YLR244C 1164 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 ERD2YBL040C 660 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 SUI1YNL244C 327 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 WRS1YOL097C 1299 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 SNF8YPL002C 702 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 YDC1YPL087W 954 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 GCD1YOR260W 1737 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 RSC3YDR303C 2658 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 GWT1YJL091C 1473 nt3.72□□□□□ -1.81
PRP46Q12417 CTR86YCR054C 1692 nt3.71□□□□□ -1.81
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