Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YGR122WYGR122W 1209 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YGR126WYGR126W 693 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YMR084WYMR084W 789 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 SEC17YBL050W 879 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YNL203CYNL203C 612 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 CAR1YPL111W 1002 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.7□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 VPS1YKR001C 2115 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 MIG1YGL035C 1515 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 MKK2YPL140C 1521 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 RIM101YHL027W 1878 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 BUD22YMR014W 1560 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 PEP8YJL053W 1140 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 AAD10YJR155W 867 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 MRP17YKL003C 396 nt5.69□□□□□ -1.5 RIP-Chip
PUF3Q07807 UIP3YAR027W 708 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 RIM11YMR139W 1113 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 COS1YNL336W 1146 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 ATG34YOL083W 1239 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 RNY1YPL123C 1305 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 DED81YHR019C 1665 nt5.69□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 PIF1YML061C 2580 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 HXT3YDR345C 1704 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 GSY2YLR258W 2118 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 RPT1YKL145W 1404 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 HRP1YOL123W 1605 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 KIN28YDL108W 921 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 COQ4YDR204W 1008 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YEL010WYEL010W 351 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 COS12YGL263W 1143 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YGR293CYGR293C 462 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YLR374CYLR374C 390 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 OXR1YPL196W 822 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 SPP381YBR152W 876 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YBR300CYBR300C 498 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 RET1YOR207C 3450 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YHR045WYHR045W 1683 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 VPS30YPL120W 1674 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 RBA50YDR527W 1320 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 UTP5YDR398W 1932 nt5.68□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 TYR1YBR166C 1359 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 CLB3YDL155W 1284 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 CAD1YDR423C 1230 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 SCW4YGR279C 1161 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 ARP1YHR129C 1155 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YJR141WYJR141W 1044 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 TFS1YLR178C 660 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 COQ9YLR201C 783 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 SSP120YLR250W 705 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YOR199WYOR199W 330 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 NUD1YOR373W 2556 nt5.67□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 SSZ1YHR064C 1617 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 TRM1YDR120C 1713 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 FOL1YNL256W 2475 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YGL117WYGL117W 798 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 MMF1YIL051C 438 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YKR047WYKR047W 306 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 RNA1YMR235C 1224 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YOR200WYOR200W 399 nt5.66□□□□□ -1.5 RIP-Chip
PUF3Q07807 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 FRE7YOL152W 1863 nt5.66□□□□□ -1.5 RIP-Chip
PUF3Q07807 NOC4YPR144C 1659 nt5.66□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 PPR1YLR014C 2715 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 RFA1YAR007C 1866 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 MHF2YDL160C-A 243 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YDR053WYDR053W 396 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 RPL24AYGL031C 468 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YIL152WYIL152W 708 nt5.65□□□□□ -1.5 RIP-Chip
PUF3Q07807 RPR2YIR015W 435 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 YJL147CYJL147C 1149 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 CYC1YJR048W 330 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 DCN1YLR128W 810 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 DAL82YNL314W 768 nt5.65□□□□□ -1.5
PUF3Q07807 KTR6YPL053C 1341 nt5.65□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 KRE29YER038C 1395 nt5.65□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 RKM2YDR198C 1440 nt5.65□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 CST9YLR394W 1449 nt5.65□□□□□ -1.51 RIP-Chip
PUF3Q07807 DUN1YDL101C 1542 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 CDC19YAL038W 1503 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 TYW3YGL050W 822 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YKR041WYKR041W 753 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 VPS21YOR089C 633 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 ENV9YOR246C 993 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 FMP23YBR047W 528 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 PRM3YPL192C 402 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 FDH2YPL275W 711 nt5.64□□□□□ -1.51 RIP-Chip
PUF3Q07807 TAX4YJL083W 1815 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 PRO2YOR323C 1371 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 STP4YDL048C 1473 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 URK1YNR012W 1506 nt5.64□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 HAP1YLR256W 4509 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 CST6YIL036W 1764 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 Q0032Q0032 291 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 SCM4YGR049W 564 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 MTW1YAL034W-A 870 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.9 ms