Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX2Q02962 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAX2Q02962 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms