Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIK1P57059 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIK1P57059 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIK1P57059 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIK1P57059 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIK1P57059 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIK1P57059 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIK1P57059 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SIK1P57059 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SIK1P57059 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIK1P57059 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIK1P57059 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIK1P57059 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIK1P57059 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIK1P57059 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIK1P57059 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIK1P57059 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIK1P57059 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIK1P57059 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIK1P57059 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SIK1P57059 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIK1P57059 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIK1P57059 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIK1P57059 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SIK1P57059 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIK1P57059 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIK1P57059 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SIK1P57059 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SIK1P57059 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIK1P57059 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIK1P57059 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIK1P57059 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIK1P57059 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIK1P57059 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIK1P57059 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIK1P57059 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIK1P57059 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIK1P57059 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIK1P57059 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIK1P57059 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIK1P57059 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIK1P57059 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIK1P57059 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIK1P57059 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIK1P57059 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIK1P57059 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIK1P57059 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIK1P57059 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIK1P57059 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIK1P57059 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIK1P57059 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIK1P57059 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIK1P57059 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SIK1P57059 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIK1P57059 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIK1P57059 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIK1P57059 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIK1P57059 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIK1P57059 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIK1P57059 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIK1P57059 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIK1P57059 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIK1P57059 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIK1P57059 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIK1P57059 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIK1P57059 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIK1P57059 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIK1P57059 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIK1P57059 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIK1P57059 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIK1P57059 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SIK1P57059 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SIK1P57059 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIK1P57059 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIK1P57059 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms