Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS1P54277 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS1P54277 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS1P54277 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS1P54277 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS1P54277 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS1P54277 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS1P54277 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS1P54277 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS1P54277 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS1P54277 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS1P54277 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS1P54277 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS1P54277 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS1P54277 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS1P54277 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS1P54277 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS1P54277 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS1P54277 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS1P54277 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS1P54277 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS1P54277 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS1P54277 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS1P54277 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS1P54277 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS1P54277 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS1P54277 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS1P54277 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS1P54277 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS1P54277 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS1P54277 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS1P54277 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS1P54277 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS1P54277 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS1P54277 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS1P54277 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS1P54277 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS1P54277 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS1P54277 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS1P54277 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS1P54277 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS1P54277 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS1P54277 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS1P54277 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS1P54277 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS1P54277 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMS1P54277 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS1P54277 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS1P54277 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS1P54277 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS1P54277 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS1P54277 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS1P54277 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS1P54277 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS1P54277 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS1P54277 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS1P54277 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS1P54277 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms