Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNFP41002 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNFP41002 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNFP41002 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNFP41002 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNFP41002 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNFP41002 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNFP41002 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNFP41002 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNFP41002 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNFP41002 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNFP41002 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNFP41002 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNFP41002 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNFP41002 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNFP41002 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNFP41002 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNFP41002 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNFP41002 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNFP41002 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNFP41002 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNFP41002 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNFP41002 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNFP41002 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNFP41002 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNFP41002 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNFP41002 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNFP41002 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNFP41002 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNFP41002 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNFP41002 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNFP41002 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNFP41002 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNFP41002 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNFP41002 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNFP41002 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNFP41002 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNFP41002 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNFP41002 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNFP41002 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNFP41002 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNFP41002 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNFP41002 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNFP41002 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNFP41002 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNFP41002 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNFP41002 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNFP41002 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNFP41002 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNFP41002 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNFP41002 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNFP41002 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNFP41002 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNFP41002 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNFP41002 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNFP41002 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNFP41002 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNFP41002 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNFP41002 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms